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GC content =========================== ・ 量 ： [りょう] 1. amount 2. volume 3. portion (of food) 4. basal metabolic rate, quantity
GC含量(GC-content)は、DNA分子中の窒素塩基のうちグアニンとシトシンの割合である〔Definition of GC – content on CancerWeb of Newcastle University,UK 〕。また、この用語はDNA・RNAの特定の断片や、ゲノム全体に対しても用いられる。 AT対が2つの水素結合で結ばれているのに対し、GC対は3つの水素結合で結ばれている。GC含量の高いDNAは低いものよりも安定しているが、この安定性は水素結合によるものではなく、主にスタッキング相互作用によるものである。遺伝物質の高い耐熱性に関わらず、高いGC含量のDNAを含む細胞は自己融解を起こし、細胞の寿命自体は短い。高GC含量のDNAを持つ生物の頑健性のため、GC含量は温度適応に重要な役割を果たすと信じられてきたが、この仮説は反証された。しかし同じ研究で、高温と（rRNA・tRNAや他のncRNAのような）構造RNAのGC含量との間で強い相関が示された。近年初めて行われた、遺伝子を中心とした体系的な大規模相関分析によって、特定のゲノム部位についてのみGC含量と温度の間に相関が見られることが示された。 PCRでは、プライマーのGC含量から相補DNAのアニーリング温度が予測される。高いGC含量を持つプライマーは、高いアニーリング温度を持つことが示唆される。 ==GC含量の決定== GC含量%は次のように計算される 。 : 別の表現としてAT/GC比があり、次のように計算される〔Definition of GC-ratio on Northwestern University, IL, USA 〕。 : これらは様々な方法で測定可能であるが、最も単純な方法の1つに、分光測色法を用いたDNAの「融点」の測定がある。DNAによる波長260nmの吸光は、二重鎖DNAが十分に加熱されて一本鎖DNAに分離すると急激に増加する。最も一般的に用いられている手法として、ATまたはGCのみに結合する蛍光色素を用いた、大量のDNAサンプルに対するフローサイトメトリーの利用がある。 別の自明な方法として、DNA・RNAの塩基配列が決定されると、単純計算によりGC含量を正確に算出できる。 抄文引用元・出典: フリー百科事典『 ウィキペディア（Wikipedia）』 ■ウィキペディアで「GC含量」の詳細全文を読む スポンサード リンク
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